Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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