Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms