Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms