Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

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Length 801 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDM4Q9UKN5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDM4Q9UKN5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDM4Q9UKN5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDM4Q9UKN5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDM4Q9UKN5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDM4Q9UKN5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDM4Q9UKN5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDM4Q9UKN5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDM4Q9UKN5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDM4Q9UKN5 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDM4Q9UKN5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDM4Q9UKN5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDM4Q9UKN5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDM4Q9UKN5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PRDM4Q9UKN5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PRDM4Q9UKN5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PRDM4Q9UKN5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRDM4Q9UKN5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRDM4Q9UKN5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRDM4Q9UKN5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRDM4Q9UKN5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRDM4Q9UKN5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRDM4Q9UKN5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRDM4Q9UKN5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRDM4Q9UKN5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRDM4Q9UKN5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRDM4Q9UKN5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRDM4Q9UKN5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM4Q9UKN5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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