Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIC8

LCMT1, Leucine carboxyl methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCMT1Q9UIC8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCMT1Q9UIC8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCMT1Q9UIC8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms