Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PCSK1NQ9UHG2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCSK1NQ9UHG2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms