Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB7

AFF4, AF4/FMR2 family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF4Q9UHB7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFF4Q9UHB7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFF4Q9UHB7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFF4Q9UHB7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
AFF4Q9UHB7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AFF4Q9UHB7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms