Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms