Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CC2D2AQ9P2K1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CC2D2AQ9P2K1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CC2D2AQ9P2K1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CC2D2AQ9P2K1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CC2D2AQ9P2K1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
CC2D2AQ9P2K1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CC2D2AQ9P2K1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CC2D2AQ9P2K1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CC2D2AQ9P2K1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CC2D2AQ9P2K1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
CC2D2AQ9P2K1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
CC2D2AQ9P2K1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CC2D2AQ9P2K1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CC2D2AQ9P2K1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CC2D2AQ9P2K1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CC2D2AQ9P2K1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CC2D2AQ9P2K1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CC2D2AQ9P2K1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CC2D2AQ9P2K1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CC2D2AQ9P2K1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CC2D2AQ9P2K1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CC2D2AQ9P2K1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CC2D2AQ9P2K1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CC2D2AQ9P2K1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CC2D2AQ9P2K1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CC2D2AQ9P2K1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
CC2D2AQ9P2K1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CC2D2AQ9P2K1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CC2D2AQ9P2K1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
CC2D2AQ9P2K1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
CC2D2AQ9P2K1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
CC2D2AQ9P2K1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
CC2D2AQ9P2K1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.74
CC2D2AQ9P2K1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.74
CC2D2AQ9P2K1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC38.32■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.73
CC2D2AQ9P2K1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
CC2D2AQ9P2K1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
CC2D2AQ9P2K1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CC2D2AQ9P2K1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
CC2D2AQ9P2K1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CC2D2AQ9P2K1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
CC2D2AQ9P2K1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CC2D2AQ9P2K1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CC2D2AQ9P2K1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CC2D2AQ9P2K1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CC2D2AQ9P2K1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CC2D2AQ9P2K1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CC2D2AQ9P2K1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CC2D2AQ9P2K1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CC2D2AQ9P2K1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CC2D2AQ9P2K1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CC2D2AQ9P2K1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CC2D2AQ9P2K1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CC2D2AQ9P2K1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CC2D2AQ9P2K1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CC2D2AQ9P2K1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CC2D2AQ9P2K1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CC2D2AQ9P2K1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms