Protein–RNA interactions for Protein: Q9P258

RCC2, Protein RCC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC2Q9P258 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCC2Q9P258 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RCC2Q9P258 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RCC2Q9P258 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
RCC2Q9P258 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms