Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VAPAQ9P0L0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VAPAQ9P0L0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
VAPAQ9P0L0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VAPAQ9P0L0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VAPAQ9P0L0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
VAPAQ9P0L0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
VAPAQ9P0L0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAPAQ9P0L0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAPAQ9P0L0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAPAQ9P0L0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAPAQ9P0L0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAPAQ9P0L0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAPAQ9P0L0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAPAQ9P0L0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAPAQ9P0L0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAPAQ9P0L0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAPAQ9P0L0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAPAQ9P0L0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAPAQ9P0L0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAPAQ9P0L0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAPAQ9P0L0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAPAQ9P0L0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAPAQ9P0L0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAPAQ9P0L0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAPAQ9P0L0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAPAQ9P0L0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAPAQ9P0L0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAPAQ9P0L0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms