Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms