Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDX18Q9NVP1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms