Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms