Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPRMQ9NS64 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms