Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS23

RASSF1, Ras association domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF1Q9NS23 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RASSF1Q9NS23 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RASSF1Q9NS23 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RASSF1Q9NS23 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RASSF1Q9NS23 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RASSF1Q9NS23 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms