Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC2

KCNK9, Potassium channel subfamily K member 9, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK9Q9NPC2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNK9Q9NPC2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms