Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00597Q9H2U6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00597Q9H2U6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00597Q9H2U6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00597Q9H2U6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00597Q9H2U6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms