Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms