Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PCGF6Q9BYE7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms