Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOL6Q9BWW8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms