Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVN2

RUSC1, RUN and SH3 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1Q9BVN2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RUSC1Q9BVN2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUSC1Q9BVN2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms