Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms