Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C9orf16Q9BUW7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C9orf16Q9BUW7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C9orf16Q9BUW7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C9orf16Q9BUW7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C9orf16Q9BUW7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf16Q9BUW7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf16Q9BUW7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf16Q9BUW7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf16Q9BUW7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf16Q9BUW7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf16Q9BUW7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf16Q9BUW7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf16Q9BUW7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf16Q9BUW7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf16Q9BUW7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf16Q9BUW7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C9orf16Q9BUW7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C9orf16Q9BUW7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C9orf16Q9BUW7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C9orf16Q9BUW7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C9orf16Q9BUW7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
C9orf16Q9BUW7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
C9orf16Q9BUW7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
C9orf16Q9BUW7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
C9orf16Q9BUW7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
C9orf16Q9BUW7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C9orf16Q9BUW7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
C9orf16Q9BUW7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C9orf16Q9BUW7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C9orf16Q9BUW7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf16Q9BUW7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms