Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms