Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LGMNQ99538 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LGMNQ99538 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LGMNQ99538 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LGMNQ99538 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LGMNQ99538 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LGMNQ99538 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LGMNQ99538 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LGMNQ99538 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LGMNQ99538 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LGMNQ99538 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LGMNQ99538 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LGMNQ99538 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LGMNQ99538 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LGMNQ99538 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LGMNQ99538 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LGMNQ99538 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LGMNQ99538 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms