Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms