Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC115Q96NT0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms