Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RUNDC3BQ96NL0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms