Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GJD4Q96KN9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms