Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIC2Q96JB3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIC2Q96JB3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIC2Q96JB3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIC2Q96JB3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIC2Q96JB3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIC2Q96JB3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIC2Q96JB3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIC2Q96JB3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIC2Q96JB3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIC2Q96JB3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIC2Q96JB3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIC2Q96JB3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIC2Q96JB3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HIC2Q96JB3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HIC2Q96JB3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HIC2Q96JB3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIC2Q96JB3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIC2Q96JB3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIC2Q96JB3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIC2Q96JB3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIC2Q96JB3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIC2Q96JB3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIC2Q96JB3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms