Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms