Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MRRFQ96E11 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MRRFQ96E11 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
MRRFQ96E11 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MRRFQ96E11 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MRRFQ96E11 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRRFQ96E11 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRRFQ96E11 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MRRFQ96E11 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRRFQ96E11 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MRRFQ96E11 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRRFQ96E11 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MRRFQ96E11 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MRRFQ96E11 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRRFQ96E11 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRRFQ96E11 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRRFQ96E11 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRRFQ96E11 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRRFQ96E11 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRRFQ96E11 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRRFQ96E11 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRRFQ96E11 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRRFQ96E11 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRRFQ96E11 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRRFQ96E11 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MRRFQ96E11 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MRRFQ96E11 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MRRFQ96E11 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MRRFQ96E11 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRRFQ96E11 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRRFQ96E11 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRRFQ96E11 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRRFQ96E11 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRRFQ96E11 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRRFQ96E11 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRRFQ96E11 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MRRFQ96E11 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MRRFQ96E11 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MRRFQ96E11 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRRFQ96E11 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRRFQ96E11 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRRFQ96E11 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRRFQ96E11 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRRFQ96E11 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRRFQ96E11 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MRRFQ96E11 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRRFQ96E11 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRRFQ96E11 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRRFQ96E11 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MRRFQ96E11 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
MRRFQ96E11 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms