Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms