Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCTD12Q96CX2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms