Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNPO1Q92973 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms