Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF30

WHAMM, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMQ8TF30 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WHAMMQ8TF30 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WHAMMQ8TF30 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WHAMMQ8TF30 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WHAMMQ8TF30 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WHAMMQ8TF30 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WHAMMQ8TF30 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WHAMMQ8TF30 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WHAMMQ8TF30 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WHAMMQ8TF30 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WHAMMQ8TF30 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
WHAMMQ8TF30 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WHAMMQ8TF30 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms