Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IGSF1Q8N6C5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IGSF1Q8N6C5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IGSF1Q8N6C5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IGSF1Q8N6C5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IGSF1Q8N6C5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IGSF1Q8N6C5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IGSF1Q8N6C5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IGSF1Q8N6C5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IGSF1Q8N6C5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IGSF1Q8N6C5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IGSF1Q8N6C5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IGSF1Q8N6C5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IGSF1Q8N6C5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IGSF1Q8N6C5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IGSF1Q8N6C5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IGSF1Q8N6C5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IGSF1Q8N6C5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IGSF1Q8N6C5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
IGSF1Q8N6C5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IGSF1Q8N6C5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms