Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU68

TMC8, Transmembrane channel-like protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC8Q8IU68 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMC8Q8IU68 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMC8Q8IU68 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMC8Q8IU68 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMC8Q8IU68 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMC8Q8IU68 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMC8Q8IU68 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMC8Q8IU68 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMC8Q8IU68 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMC8Q8IU68 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMC8Q8IU68 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMC8Q8IU68 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMC8Q8IU68 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMC8Q8IU68 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMC8Q8IU68 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMC8Q8IU68 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMC8Q8IU68 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMC8Q8IU68 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMC8Q8IU68 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMC8Q8IU68 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMC8Q8IU68 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMC8Q8IU68 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMC8Q8IU68 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMC8Q8IU68 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMC8Q8IU68 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMC8Q8IU68 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMC8Q8IU68 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMC8Q8IU68 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMC8Q8IU68 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMC8Q8IU68 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMC8Q8IU68 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMC8Q8IU68 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMC8Q8IU68 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMC8Q8IU68 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMC8Q8IU68 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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