Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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