Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SV2AQ7L0J3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms