Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms