Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms