Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO38Q6PIJ6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms