Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTE8

MRNIP, MRN complex-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRNIPQ6NTE8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
MRNIPQ6NTE8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRNIPQ6NTE8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms