Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE9

LCN8, Epididymal-specific lipocalin-8, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN8Q6JVE9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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LCN8Q6JVE9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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LCN8Q6JVE9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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LCN8Q6JVE9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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LCN8Q6JVE9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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LCN8Q6JVE9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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LCN8Q6JVE9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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LCN8Q6JVE9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LCN8Q6JVE9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LCN8Q6JVE9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LCN8Q6JVE9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LCN8Q6JVE9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LCN8Q6JVE9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LCN8Q6JVE9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LCN8Q6JVE9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LCN8Q6JVE9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LCN8Q6JVE9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LCN8Q6JVE9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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LCN8Q6JVE9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LCN8Q6JVE9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LCN8Q6JVE9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LCN8Q6JVE9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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LCN8Q6JVE9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LCN8Q6JVE9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LCN8Q6JVE9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LCN8Q6JVE9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LCN8Q6JVE9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LCN8Q6JVE9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LCN8Q6JVE9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
LCN8Q6JVE9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LCN8Q6JVE9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LCN8Q6JVE9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LCN8Q6JVE9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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LCN8Q6JVE9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN8Q6JVE9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN8Q6JVE9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN8Q6JVE9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN8Q6JVE9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN8Q6JVE9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN8Q6JVE9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN8Q6JVE9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN8Q6JVE9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN8Q6JVE9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN8Q6JVE9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN8Q6JVE9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN8Q6JVE9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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