Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms