Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKR9

FAM104B, Protein FAM104B, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM104BQ5XKR9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM104BQ5XKR9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms