Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RRAGBQ5VZM2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 432.6 ms