Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TAF3Q5VWG9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms